{"id":981,"date":"2024-10-08T10:32:00","date_gmt":"2024-10-08T10:32:00","guid":{"rendered":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/?p=981"},"modified":"2024-10-28T08:14:52","modified_gmt":"2024-10-28T07:14:52","slug":"biosourcer-molecules-trois-petits-points","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/biosourcer-molecules-trois-petits-points\/","title":{"rendered":"Biosourcer la fabrication des mol\u00e9cules"},"content":{"rendered":"<figure class=\"wp-block-embed is-type-video is-provider-youtube wp-block-embed-youtube wp-embed-aspect-16-9 wp-has-aspect-ratio\"><div class=\"wp-block-embed__wrapper\">\n<iframe loading=\"lazy\" title=\"Un programme pour biosourcer les mol\u00e9cules\" width=\"790\" height=\"444\" src=\"https:\/\/www.youtube.com\/embed\/gNAWcwvdI0M?feature=oembed\" frameborder=\"0\" allow=\"accelerometer; autoplay; clipboard-write; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture; web-share\" referrerpolicy=\"strict-origin-when-cross-origin\" allowfullscreen><\/iframe>\n<\/div><\/figure>\n\n\n\n<div style=\"height:30px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">Biosourcer les mol\u00e9cules<\/h2>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">C\u2019est-\u00e0-dire produire des compos\u00e9s chimiques \u00e0 partir de ressources biologiques renouvelables (comme des plantes, des micro-organismes ou des d\u00e9chets organiques), pr\u00e9sente plusieurs avantages pour le d\u00e9veloppement durable.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Voici pourquoi cette approche est b\u00e9n\u00e9fique : <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">1. R\u00e9duction de la d\u00e9pendance aux ressources fossiles Traditionnellement, de nombreuses mol\u00e9cules utilis\u00e9es dans l&rsquo;industrie chimique, pharmaceutique, ou \u00e9nerg\u00e9tique sont d\u00e9riv\u00e9es du p\u00e9trole. En rempla\u00e7ant les mati\u00e8res premi\u00e8res fossiles par des ressources biosourc\u00e9es, on diminue la d\u00e9pendance \u00e0 des ressources limit\u00e9es et non renouvelables. <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">2. R\u00e9duction des \u00e9missions de gaz \u00e0 effet de serre Les proc\u00e9d\u00e9s p\u00e9trochimiques sont souvent tr\u00e8s polluants et \u00e9metteurs de gaz \u00e0 effet de serre (GES). En revanche, les ressources biosourc\u00e9es capturent le dioxyde de carbone (CO2) lors de leur croissance. <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">3. Biod\u00e9gradabilit\u00e9 et moindre pollution Les mol\u00e9cules issues de ressources biosourc\u00e9es ont souvent l\u2019avantage d\u2019\u00eatre plus facilement biod\u00e9gradables que leurs \u00e9quivalents synth\u00e9tiques. Cela r\u00e9duit la pollution. <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Depuis quelques ann\u00e9es, une r\u00e9volution est en marche : il devient possible de cr\u00e9er de l\u2019ADN plus rapidement, de mani\u00e8re plus fiable, et en tant qu&rsquo;alternative \u00e0 la p\u00e9trochimie, de guider pr\u00e9cis\u00e9ment les organismes vivants pour qu&rsquo;ils synth\u00e9tisent des mol\u00e9cules utiles. Dans le domaine de la biologie synth\u00e9tique, en plus d&rsquo;une multitude d&rsquo;\u00e9quipements exp\u00e9rimentaux, de nombreux outils logiciels permettent d\u2019atteindre cet objectif. <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Cependant, ces outils sont dispers\u00e9s, difficiles \u00e0 localiser, \u00e0 installer et \u00e0 rendre interop\u00e9rables. De plus, les r\u00e9sultats peuvent varier selon l&rsquo;ordinateur utilis\u00e9. Pour surmonter ces d\u00e9fis, une communaut\u00e9 a d\u00e9velopp\u00e9 un entrep\u00f4t d&rsquo;outils pour la biologie synth\u00e9tique, l&rsquo;ing\u00e9nierie m\u00e9tabolique et la biotechnologie industrielle : Galaxy-SynBioCAD. <\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-text-align-center wp-block-paragraph\"><a href=\"https:\/\/www.ifpenergiesnouvelles.fr\/enjeux-et-prospective\/decryptages\/energies-renouvelables\/chimie-biosourcee\">Qu&rsquo;est-ce que la chimie biosourc\u00e9e ?<\/a><\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Aujourd&rsquo;hui, les chercheurs et les industriels utilisent plusieurs outils manuellement. Ils doivent reformater les donn\u00e9es entre chaque analyse pour obtenir les r\u00e9sultats attendus. Ce travail laborieux peut \u00eatre facilement simplifi\u00e9 gr\u00e2ce au syst\u00e8me Galaxy. Pour produire un compos\u00e9 d&rsquo;int\u00e9r\u00eat \u00e0 partir d&rsquo;un organisme vivant, l\u2019\u00e9quipe du Professeur Faulon et ses partenaires ont d\u00e9velopp\u00e9 des outils d\u00e9di\u00e9s.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\"> Ils les ont int\u00e9gr\u00e9s dans des workflows Galaxy permettant de les utiliser via une interface en un clic. Le premier workflow, appel\u00e9 Retrosynthesis, demande \u00e0 l\u2019utilisateur la structure mol\u00e9culaire de la mol\u00e9cule qu\u2019il souhaite produire et une description formalis\u00e9e de l\u2019organisme vivant utilis\u00e9 pour la synth\u00e8se. <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Les techniques de r\u00e9trosynth\u00e8se permettent d\u2019identifier les voies m\u00e9taboliques, \u00e0 partir des m\u00e9tabolites natifs de l\u2019h\u00f4te, qui permettent la bioproduction de la mol\u00e9cule souhait\u00e9e. Le second workflow, nomm\u00e9 Pathway Analysis, analyse les voies m\u00e9taboliques identifi\u00e9es par Retrosynthesis et d\u00e9termine lesquelles sont les plus adapt\u00e9es pour produire la mol\u00e9cule. Plusieurs crit\u00e8res sont pris en compte, comme la vitesse des r\u00e9actions, la thermodynamique, ou encore la longueur de la voie m\u00e9tabolique.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\"> Le troisi\u00e8me workflow, appel\u00e9 Genetic Design, demande \u00e0 l\u2019utilisateur de choisir une voie m\u00e9tabolique, souvent la meilleure identifi\u00e9e par Pathway Analysis. Il fournit ensuite des scripts Python qui permettent de piloter un robot pour automatiser la construction de plasmides, n\u00e9cessaires \u00e0 la production des enzymes pour la voie m\u00e9tabolique choisie.<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\"> Nous sommes clairement \u00e0 un stade o\u00f9 l\u2019ing\u00e9nierie des voies m\u00e9taboliques est presque enti\u00e8rement g\u00e9r\u00e9e par des logiciels. <\/h2>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">En connectant des outils logiciels et des robots via Galaxy-SynBioCAD, nous passons d\u2019une \u00e9poque comparable \u00e0 MS-DOS \u00e0 celle de Windows. La r\u00e9volution de la biologie synth\u00e9tique peut d\u00e9sormais suivre son cours, avec de nombreuses applications, de la p\u00e9trochimie \u00e0 la m\u00e9decine, en passant par les nanotechnologies. <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Trois petits points vous accompagne dans tous vos travaux de valorisation de la recherche et de communication scientifique :<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-text-align-center wp-block-paragraph\"><a href=\"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/sujets\/outils-valorisation-recherche\/video-scientifique\/\">Voir nos articles<\/a><\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\"> Nos Outils Vid\u00e9os Educatives : <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Des narrations visuelles engageantes qui simplifient la complexit\u00e9 scientifique. Bande Dessin\u00e9e Scientifique : <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Prendre rendez-vous : https:\/\/meet.brevo.com\/jerome-laniau\/presentation <\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Nous contacter : https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/contact<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Biosourcer les mol\u00e9cules, c\u2019est-\u00e0-dire produire des compos\u00e9s chimiques \u00e0 partir de ressources biologiques renouvelables, pr\u00e9sente plusieurs avantages pour le d\u00e9veloppement durable. <\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":982,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[303],"tags":[613,366],"class_list":["post-981","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-sciences-trois-petits-points","tag-biosourcer","tag-workflow"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/981","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=981"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/981\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1921,"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/981\/revisions\/1921"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media\/982"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=981"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=981"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/valo.troispetitspoints.org\/en\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=981"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}